Сведения органов жилищного надзора о том, что квартира или дом являются непригодными для проживания, признаются законным основанием для отказа в удовлетворении заявления о распоряжении средствами маткапитала на улучшение жилищных условий. 
Пресс-служба Отделения Пенсионного фонда РФ по КБР поясняет, что информацию о состоянии жилого помещения Пенсионный фонд и его территориальные отделения запрашивают в органах местного самоуправления, государственного жилищного надзора и муниципального жилищного контроля, которые предоставляют сведения не только о пригодности помещения для проживания, но и, например, о том, подлежит ли дом сносу или реконструкции. Такие сведения ПФР запрашивает практически во всех случаях распоряжения материнским капиталом на улучшение жилищных условий семьи: при покупке жилья, погашении кредита или займа и в случае компенсации расходов на уже построенное жильё.
Ещё одной мерой по повышению эффективности распоряжения материнским капиталом является исключение организаций, неподконтрольных Центральному банку, из перечня тех, чьи займы можно оплачивать материнским капиталом. Обычно такие организации предоставляют ипотечные займы по более высокой процентной ставке по сравнению с банковскими кредитами, что значительно увеличивает расходы семей на приобретение жилья и повышает риск несвоевременной оплаты либо невыплаты долга и процентов по займу. Как следствие, семья может потерять заложенное жильё, которое часто является единственным.
Перечень организаций, выдающих займы под использование материнского капитала, дополнен Единым институтом развития в жилищной сфере ДОМ.РФ (ранее – Агентство по ипотечному жилищному кредитованию) и сельскохозяйственными потребительскими кредитными кооперативами. В установленный законом исчерпывающий перечень организаций, займы которых могут погашаться материнским капиталом, вошли кредитные организации, кредитные потребительские кооперативы и кредитные сельскохозяйственные потребительские кооперативы, работающие не менее трёх лет, а также Единый институт развития в жилищной сфере ДОМ.РФ.
Пенсионный фонд России обязан проинформировать владельца сертификата о том, что материнский капитал израсходован полностью. Уведомление направляется в течение месяца с даты последнего платежа, завершающего расходование средств.